本发明公开了一种复合磁性聚氨酯泡沫载体的制备方法和应用，该方法是将磁性微粒表面经过处理后，通过超声波和机械分散方法将其分散于聚氨酯泡沫的制备原料中，再通过泡沫发泡聚合得到具有生物磁性的多孔固定化微生物聚氨酯泡沫载体，本发明提高聚氨酯泡沫载体的吸附性能、亲水性能及强度；同时，磁性粒子使整个载体带有微弱的磁场，其产生的物理、化学以及生物磁致效应，具有刺激菌群良性生长代谢，提高污染物的降解速率，并且聚氨酯泡沫载体具有丰富的孔结构，为微生物提供了增殖空间，还对固定微生物起到保护作用，使固定化微生物保持较高的活力，两者的协同作用，进一步提高了固定化微生物的活性。